在高盐有机废水焚烧前，应当过滤废水中的悬浮物，或者采用加热等方法降低废水黏度，以防止堵塞喷嘴并提高废液雾化效率。对于不同类型的工业高盐废水，有时还要进行酸碱中和处理，以防止酸腐蚀设备、过碱出现污垢。在焚烧阶段，焚烧温度需要根据高盐废水物性确定，还需控制焚烧时间、通气量等因素，以达到较好的焚烧效果。最后，在烟气处理阶段，由于废液中常含有N、S、Cl等元素，通常焚烧会产生含NOx、SOx和HCl的污染性气体。因此，对产生的烟气需进行净化处理，达标后才可排放。
一般地，降低废水COD的方法可分为物化法和生物法。其中，生物法具有成本低等优点，是首选处理方法。对于生化性较差的废水，采用物化-生化耦合工艺技术进行处理，已经成为当今难生化废水处理技术的发展趋势。近年来，各种用于废水处理的耐盐菌已经得到了深入的研究与利用，使得处理废水的盐含量有一定提高。
反硝化，对于需要脱N的污水，曝气生物滤池的反硝化通常有前置反硝化和后置反硝化两种。前置反硝化的前提是满足系统反硝化的碳源要求，废水首先经过DN滤池或滤池的DN段(把反硝化和硝化组合在1个滤池中，通过对不同滤料中的组合达到硝化和反硝化的目的)。然后经过好氧滤池或滤池的好氧段，好氧池出水回流到反硝化滤池，硝化滤池的出水NO-3-N回流到反硝化滤池，反硝化菌利用进水中的有机物作为电子供体，NO-3-N作为电子受体，进行电子转移，最终转化为N2转移至空气中，达到废水脱氮的目的。
